Όλα ξεκινανε όταν το αεροπλάνο που εκτελούσε την πτήση Σίδνεϋ - Λος Αντζελες πέφτει σ"ενα νησι κάπου στον Ειρηνικό Ωκεανό. Τα άτομα τα οποια επιζούν απο την πτώση ειναι 48. Ανάμεσα τους ένας γιατρός, μια κατάδικος, ένας εκατομυριούχος, ενας τυχοδιώκτης, ένας Ιρακινός κομάντο, ένας περίεργος μεσήλικας, ένας ροκ σταρ, ένα ζευγαρι Κορεατών, 2 αδέρφια και αλλοι πολλοί.... Στην αρχή το νησί μοιάζει να είναι ήρεμο και οι επιζόντες πιστεύουν πως έχουν να αντιμετωπίσουν μόνο τα στοιχεία της φύσης... Αφού περνάνε οι μέρες και οι ελπίδες τους πως θα έρθει κάποιος να τους σώσει εξαφανίζονται τότε αποφασίζουν πως πρέπει μόνοι τους να βρουν τρόπο να φύγουν απο το νησί. Τίποτε δεν είναι αυτό που φαίνεται στο νησί το μόνο προφανές είναι ότι όλοι αυτοί οι άνθρωποι συνδέονται κατά κάποιον τρόπο κι ότι ο καθένας τους βρίσκεται εκεί για κάποιο συγκεκριμένο λόγο....

Ο Πάντυ Κλήρυ μεταναστεύει μαζί με τη γυναίκα του Φιόνα και τα επτά παιδιά τους από τη Νέα Ζηλανδία στην Αυστραλία, στη Ντρόγκεντα, το απέραντο αγρόκτημα της δεσποτικής και άκληρης αδερφής του. Μισό αιώνα αργότερα η μοναδική εκπρόσωπος της τρίτης γενιάς της οικογένειας, Τζουστίν Ο' Νηλ, μια πετυχημένη ηθοποιός, αποφασίζει να χαράξει το δρόμο της μακριά από τις ρίζες της. Οι κεντρικοί χαρακτήρες αυτής της συναρπαστικής ιστορίας είναι η αδάμαστη Μέγκυ, η μοναδική θυγατέρα των Κλήρυ και ο μόνος άντρας που θ' αγαπήσει αληθινά στη ζωή της, ο εκθαμβωτικά ωραίος και φιλόδοξος ιερέας Ραλφ ντε Μπρικασσάρ.

Στην αρχή της σειράς εμφανίζονται πέντε κύριοι πολιτισμοί: Οι κύριες φυλές είναι οι Άνθρωποι, οι Μινμπάρι, οι Ναρν, οι Κενταυριανοί και οι Βόρλον. Οι Σκιές και οι διάφοροι σύμμαχοι τους είναι κακόβουλα είδη που εμφανίζονται κατά την εξέλιξη της σειράς. Εμφανίζονται επίσης και αρκετές άλλες φυλές λιγότερο ισχυρές, οι οποίες ανήκουν στην Ομάδα Αδέσμευτων Κόσμων, όπως οι Ντράζι, οι Μπρακίρι, οι Βρη, οι Μάρκαμπ και οι Πακ'μα'ρα. Οι προηγούμενοι τρεις σταθμοί με το ίδιο όνομα (ο αρχικός σταθμός Βαβυλών, ο Βαβυλών 2 και ο Βαβυλών 3) είτε υπέστησαν δολιοφθορά είτε καταστράφηκαν από ατύχημα πριν την ολοκλήρωση της κατασκευής τους. Ο τέταρτος σταθμός, ο Βαβυλών 4, εξαφανίστηκε χωρίς κανένα ίχνος 24 ώρες μετά την έναρξη της λειτουργίας του