Αποφασισμένος να αποδείξει την σπουδαιότητά του στο νησί Σόντορ, ο Τόμας παίρνει τα φορτηγά του Τζέιμς και ξεκινά μια μεγάλη περιπέτεια στην Ενδοχώρα. Στη διαδρομή πιάνει φιλίες με τα χαρωπά και πολύ εξυπηρετικά «Πειραματικά Τρένα», όμως, ύστερα από μια λάθος στροφή, βρίσκεται χαμένος στα Χαλυβουργεία. Εκεί ο Τόμας συναντά δύο μυστηριώδεις μηχανές που αμέσως τον κάνουν να αισθάνεται καλοδεχούμενος, αλλά τα φαινόμενα απατούν... Αφού ο Τόμας δεν έχει καταφέρει να επιστρέψει, ο Τζέιμς ξεκινά για την Ενδοχώρα αλλά βρίσκεται και ο ίδιος μπλεγμένος, οπότε τώρα είναι στο χέρι του Τόμας και των Πειραματικών Τρένων να σώσουν την κατάσταση.

Ενθουσιασμός κυριαρχεί στο νησί του Σόντορ με την έλευση ενός νέου ασυνήθιστου τρένου. Όλοι ανησυχούν ότι θα αντικατασταθούν από τον γρήγορο και μοντέρνο Ούγκο και δεν καταφέρνουν να γίνουν φίλοι του μιας και δεν τον κάνουν να νιώσει καλοδεχούμενος. Όταν όμως, σταματούν και τον ακούν, συνειδητοποιούν ότι ο Ούγκο είναι ένα πολύ ξεχωριστό τρένο που πραγματικά αξίζει να βρίσκεται στις ράγες. Σε ένα διαφορετικό μέρος τα πράγματα δείχνουν λίγο στοιχειωμένα όταν τα τρένα βλέπουν ένα τρένο-φάντασμα και ο Πέρσυ ξεκινά ένα κυνήγι τεράτων. Ο Σκιφ μαζί με τον κύριο Χοντροπατάτα ξεκινούν μία ξέφρενη κούρσα στο κυνήγι μιας γοργόνας. Ο Χιούγκο ονειρεύεται ότι κατακτά τους αιθέρες και η Τζούντι μαζί με τον Τζερόμ μαθαίνουν τι πραγματικά χρειάζεται για να νιώσεις χρήσιμος ξανά.

Ύστερα από μια κυβερνο-επίθεση, η οποία αποκαλύπτει όλους τους Βρετανούς μυστικούς πράκτορες, ο Τζόνι Ίνγκλις επιστρέφει στην ενεργό δράση για να ανακαλύψει τους επικίνδυνους χάκερ.