Ο θρυλικός δολοφόνος Κενσιν Χιμούρα, δέκα χρόνια μετά την Επανόρθωση Μέιτζι έχει γίνει ένας περιπλανώμενος σαμουράι. Προσφέρει βοήθεια και προστατεύει όσους το χρειάζονται για να ξεπληρώσει τις παλιές του αμαρτίες. Στο ταξίδι του προς το Τόκιο, συναντάει την Καόρου Καμίγια, την ιδιοκτήτρια και δασκάλα ενός Ντοτζο ξιφασκίας. Η Καόρου προσκαλεί τον Κένσιν να μείνει στο Ντότζο της. Η σχέση τους εξελίσσεται περισσότερο αλλά το παρελθόν του Κένσιν επιστρέφει για να τον στοιχειώσει.

Αναζητώντας έναν ευγενή σκοπό, ο εξαθλιωμένος σαμουράι Hanshiro επιθυμεί να διαπράξει το τελετουργικό της αυτοκτονίας (χαρακίρι) στον Οίκο των Ii, που διευθύνεται από τον Kageyu. Προσπαθώντας να απορρίψει το αίτημα του Hanshiro, ο Kageyu αφηγείται την τραγική ιστορία ενός πρόσφατου παρόμοιου αιτήματος από τον νεαρό σαμουράι Motome. Ο Hanshiro συγκλονίζεται από τις απάνθρωπες λεπτομέρειες της μοίρας του Motome, αλλά παραμένει πιστός στην απόφασή του να πεθάνει με τιμή. Κατά τη στιγμή του hara-kiri, ο Hanshiro κάνει μια τελευταία παράκληση να τον βοηθήσει ο σαμουράι του Kageyu, ο οποίος συμπτωματικά απουσιάζει. Καχύπτος και εξοργισμένος, ο Kageyu ζητά εξηγήσεις. Ο Hanshiro ομολογεί την σχέση με τον Motome, και αφηγείται την γλυκόπικρη ιστορία της ζωής τους ... Ο Kageyu σύντομα θα συνειδητοποιήσει ότι ο Hanshiro σχεδιάζει μια εκδικητική αναμέτρηση εναντίον του οίκου του.

Μετά την ήττα του από τον Σισίο, ο Κένσιν πέφτει στην θάλασσα για να σώσει την Καόρου. Το άτομο που τον σώζει είναι κάποιος από το παρελθόν του, ο παλιός του δάσκαλος που θα του διδάξει την τελευταία κίνηση της τεχνικής Χίτεν Μιτσουρούγκι. Εντωμεταξύ ο Σισίο με το μαύρο πλοίο του φτάνει στις ακτές του Τόκιο και απειλεί να το πυρπολήσει. Η κυβέρνηση υποκύπτει στις απαιτήσεις του και κηρύσσει τον Κένσιν ως φυγά και δολοφόνο της προηγούμενης εποχής του Σογκουνάτου. Για άλλη μια φορά ο Κένσιν θα αντιμετωπίσει με του συμμάχους του τον Σισίο και τον στρατό του.

Ο Κένσιν έχει συνηθίσει στην νέα ζωή του με την Καόρου και τους άλλους φίλους τους, όταν δέχεται ένα αίτημα από την Κυβέρνηση Μέιτζι. Ο Σισίο Μακότο, ένας πρώην δολοφόνος, επέζησε αφού τον πρόδωσαν και τον έκαψαν ζωντανό. Τώρα βρίσκεται στο Κιότο και συνωμοτεί με τους πολεμιστές που έχει συγκεντρώσει, να ρίξουν την νέα κυβέρνηση. Αντίθετα από την επιθυμία της Καόρου, ο Κένσιν, δέχεται να πάει στο Κιότο να πολεμήσει τον Σισίο και να ανατρέψει ένα νέο εμφύλιο πόλεμο.

Ο πρώην ντετέκτιβ Fujishima ψάχνει την κόρη του που έχει εξαφανιστεί. Οι έρευνες τον φέρνουν αντιμέτωπο με τρομακτικά μυστικά και την άγνωστη διπλή ζωή της κόρης του.

Δύο Πορτογάλοι ιησουίτες καταφθάνουν στην Ιαπωνία του 1640, όπου η χριστιανική πίστη διώκεται απηνώς, για να βρουν τα ίχνη του δασκάλου τους πατέρα Φερέιρα, για τον οποίο υπάρχουν φήμες πως έχει αλλαξοπιστήσει.

Το 1879, ο Κένσιν και οι σύμμαχοί του έρχονται αντιμέτωποι με τον ισχυρότερο εχθρό τους: τον πρώην κουνιάδο του, Ενίσι Γιουκίσιρο, και τους φιλέκδικους ακόλουθούς του.

Ένα ζευγάρι μεγαλοαστών από το Τόκιο εγκαταλείπει τις επώδυνες θεραπείες γονιμότητας και υιοθετεί τον Ασάτο, καρπό μιας επιπόλαιης εφηβικής αγάπης. Έξι χρόνια αργότερα, η νεαρή βιολογική μητέρα του Ασάτο εμφανίζεται από το πουθενά, μετανιωμένη για τα λάθη του παρελθόντος, πασχίζοντας να ξαναμπεί στη ζωή του παιδιού της. Συνυφαίνοντας με δεξιοτεχνία χρονικά επίπεδα, αφηγηματικά στιλ και κινηματογραφικά είδη –οικογενειακό δράμα, νεανικό ρομάντζο, κοινωνικό ρεαλισμό, αλλά και φινιρισμένες πινελιές θρίλερ–, αυτή η συγκινητική σπουδή χαρακτήρων εξερευνά τις έννοιες της οικογένειας και της μητρότητας.

Στη μεταπολεμική Ιαπωνία, αναδύεται ένας νέος τρόμος, ο Godzilla. Θα μπορέσουν οι συντετριμμένοι άνθρωποι να επιβιώσουν... πόσο μάλλον να αντεπιτεθούν;